MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 51682

< Previous12...9293949596979899100101102103104Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_021883	TCA	2	6	2649893	2649898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526469921
51502	NC_021883	AAT	2	6	2649900	2649905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526469921
51503	NC_021883	ATT	2	6	2649962	2649967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469921
51504	NC_021883	AGT	2	6	2649992	2649997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469921
51505	NC_021883	GAT	2	6	2650032	2650037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469921
51506	NC_021883	GAT	2	6	2650062	2650067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469921
51507	NC_021883	ATT	2	6	2650117	2650122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469921
51508	NC_021883	AGA	2	6	2650143	2650148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526469921
51509	NC_021883	ATC	2	6	2650163	2650168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526469921
51510	NC_021883	AATAA	2	10	2650173	2650182	80 %	20 %	0 %	0 %	526469921
51511	NC_021883	TTAA	2	8	2650248	2650255	50 %	50 %	0 %	0 %	526469921
51512	NC_021883	ATT	2	6	2650273	2650278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469921
51513	NC_021883	CAAT	2	8	2650279	2650286	50 %	25 %	0 %	25 %	526469921
51514	NC_021883	TA	4	8	2650351	2650358	50 %	50 %	0 %	0 %	526469921
51515	NC_021883	GAT	2	6	2650359	2650364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469921
51516	NC_021883	CTTA	2	8	2650391	2650398	25 %	50 %	0 %	25 %	526469921
51517	NC_021883	TTTAT	2	10	2650444	2650453	20 %	80 %	0 %	0 %	526469922
51518	NC_021883	A	6	6	2650594	2650599	100 %	0 %	0 %	0 %	526469922
51519	NC_021883	TGA	2	6	2650614	2650619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469922
51520	NC_021883	TA	3	6	2650678	2650683	50 %	50 %	0 %	0 %	526469922
51521	NC_021883	TA	3	6	2650730	2650735	50 %	50 %	0 %	0 %	526469922
51522	NC_021883	AGT	2	6	2650752	2650757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469922
51523	NC_021883	ATG	2	6	2650766	2650771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469922
51524	NC_021883	TAT	2	6	2650772	2650777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469922
51525	NC_021883	AAG	2	6	2650793	2650798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526469922
51526	NC_021883	TAA	2	6	2650818	2650823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526469922
51527	NC_021883	TA	3	6	2650880	2650885	50 %	50 %	0 %	0 %	526469922
51528	NC_021883	A	6	6	2650984	2650989	100 %	0 %	0 %	0 %	526469922
51529	NC_021883	TGG	2	6	2651028	2651033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526469922
51530	NC_021883	TACA	2	8	2651054	2651061	50 %	25 %	0 %	25 %	526469922
51531	NC_021883	GATTAT	2	12	2651140	2651151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	526469922
51532	NC_021883	TGC	2	6	2651205	2651210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526469922
51533	NC_021883	TGA	2	6	2651238	2651243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469922
51534	NC_021883	GA	3	6	2651242	2651247	50 %	0 %	50 %	0 %	526469922
51535	NC_021883	GAAG	2	8	2651250	2651257	50 %	0 %	50 %	0 %	526469922
51536	NC_021883	TTG	2	6	2651273	2651278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526469922
51537	NC_021883	AGAA	2	8	2651374	2651381	75 %	0 %	25 %	0 %	526469922
51538	NC_021883	ATG	2	6	2651404	2651409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469922
51539	NC_021883	TTGA	2	8	2651410	2651417	25 %	50 %	25 %	0 %	526469922
51540	NC_021883	ACA	2	6	2651452	2651457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526469922
51541	NC_021883	GC	3	6	2651463	2651468	0 %	0 %	50 %	50 %	526469922
51542	NC_021883	TTTA	2	8	2651472	2651479	25 %	75 %	0 %	0 %	526469922
51543	NC_021883	ACTT	2	8	2651530	2651537	25 %	50 %	0 %	25 %	526469923
51544	NC_021883	TAAT	2	8	2651560	2651567	50 %	50 %	0 %	0 %	526469923
51545	NC_021883	TA	3	6	2651590	2651595	50 %	50 %	0 %	0 %	526469923
51546	NC_021883	TA	3	6	2651713	2651718	50 %	50 %	0 %	0 %	526469923
51547	NC_021883	ATT	2	6	2651732	2651737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469923
51548	NC_021883	AATT	2	8	2651750	2651757	50 %	50 %	0 %	0 %	526469923
51549	NC_021883	GTG	3	9	2651875	2651883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526469923
51550	NC_021883	TGC	2	6	2651888	2651893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526469923
51551	NC_021883	CAT	2	6	2651957	2651962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526469923
51552	NC_021883	GCTT	2	8	2652000	2652007	0 %	50 %	25 %	25 %	526469923
51553	NC_021883	TCA	2	6	2652125	2652130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526469923
51554	NC_021883	TCC	2	6	2652142	2652147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526469923
51555	NC_021883	GA	3	6	2652200	2652205	50 %	0 %	50 %	0 %	526469923
51556	NC_021883	ACA	2	6	2652206	2652211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526469923
51557	NC_021883	TAT	2	6	2652289	2652294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469923
51558	NC_021883	TAGC	2	8	2652313	2652320	25 %	25 %	25 %	25 %	526469923
51559	NC_021883	GAA	2	6	2652395	2652400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526469924
51560	NC_021883	GAAC	2	8	2652529	2652536	50 %	0 %	25 %	25 %	526469924
51561	NC_021883	TAG	2	6	2652557	2652562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469924
51562	NC_021883	AGA	2	6	2652606	2652611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526469924
51563	NC_021883	AGT	2	6	2652702	2652707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469924
51564	NC_021883	ACA	2	6	2652715	2652720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526469924
51565	NC_021883	TCA	2	6	2652819	2652824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526469924
51566	NC_021883	TGT	2	6	2652857	2652862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526469924
51567	NC_021883	GCA	2	6	2652868	2652873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526469924
51568	NC_021883	A	6	6	2652945	2652950	100 %	0 %	0 %	0 %	526469924
51569	NC_021883	TTTAA	2	10	2652955	2652964	40 %	60 %	0 %	0 %	526469924
51570	NC_021883	GTTA	2	8	2652979	2652986	25 %	50 %	25 %	0 %	526469924
51571	NC_021883	GGA	2	6	2653096	2653101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526469924
51572	NC_021883	AT	3	6	2653136	2653141	50 %	50 %	0 %	0 %	526469924
51573	NC_021883	ATT	2	6	2653188	2653193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469924
51574	NC_021883	TGA	2	6	2653221	2653226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469924
51575	NC_021883	TA	3	6	2653310	2653315	50 %	50 %	0 %	0 %	526469924
51576	NC_021883	ATT	2	6	2653331	2653336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51577	NC_021883	CT	3	6	2653342	2653347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51578	NC_021883	ATT	2	6	2653356	2653361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51579	NC_021883	TAAT	2	8	2653374	2653381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51580	NC_021883	ATTA	2	8	2653420	2653427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51581	NC_021883	A	8	8	2653446	2653453	100 %	0 %	0 %	0 %	526469925
51582	NC_021883	TAC	2	6	2653459	2653464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526469925
51583	NC_021883	ATT	3	9	2653465	2653473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469925
51584	NC_021883	CAA	2	6	2653634	2653639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526469925
51585	NC_021883	TGGGTG	2	12	2653671	2653682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526469925
51586	NC_021883	AT	3	6	2653710	2653715	50 %	50 %	0 %	0 %	526469925
51587	NC_021883	TGG	2	6	2653756	2653761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526469925
51588	NC_021883	GTC	2	6	2653969	2653974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526469925
51589	NC_021883	AAT	2	6	2654027	2654032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526469925
51590	NC_021883	GGT	2	6	2654063	2654068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526469925
51591	NC_021883	ATTAC	2	10	2654168	2654177	40 %	40 %	0 %	20 %	526469925
51592	NC_021883	TAA	2	6	2654242	2654247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526469925
51593	NC_021883	CAA	2	6	2654249	2654254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526469925
51594	NC_021883	GGA	2	6	2654306	2654311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526469925
51595	NC_021883	TGA	2	6	2654317	2654322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469925
51596	NC_021883	GTG	2	6	2654337	2654342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526469925
51597	NC_021883	TTA	2	6	2654456	2654461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469925
51598	NC_021883	CAAT	2	8	2654468	2654475	50 %	25 %	0 %	25 %	526469925
51599	NC_021883	AAGATA	2	12	2654502	2654513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	526469925
51600	NC_021883	TAC	2	6	2654578	2654583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526469925
51601	NC_021883	A	6	6	2654645	2654650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51602	NC_021883	A	6	6	2654656	2654661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51603	NC_021883	AGA	2	6	2654702	2654707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526469926
51604	NC_021883	A	6	6	2654707	2654712	100 %	0 %	0 %	0 %	526469926
51605	NC_021883	T	6	6	2654715	2654720	0 %	100 %	0 %	0 %	526469926
51606	NC_021883	TGT	2	6	2654732	2654737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526469926
51607	NC_021883	ATT	2	6	2654749	2654754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469926
51608	NC_021883	TAT	2	6	2654776	2654781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469926
51609	NC_021883	GTTC	2	8	2654827	2654834	0 %	50 %	25 %	25 %	526469926
51610	NC_021883	AAT	2	6	2654839	2654844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526469926
51611	NC_021883	GAT	2	6	2654905	2654910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469926
51612	NC_021883	TTCAG	2	10	2654916	2654925	20 %	40 %	20 %	20 %	526469926
51613	NC_021883	AT	3	6	2654928	2654933	50 %	50 %	0 %	0 %	526469926
51614	NC_021883	AAC	2	6	2654954	2654959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526469926
51615	NC_021883	AAG	2	6	2655047	2655052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526469926
51616	NC_021883	AGA	2	6	2655141	2655146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526469926
51617	NC_021883	A	6	6	2655152	2655157	100 %	0 %	0 %	0 %	526469926
51618	NC_021883	TTA	2	6	2655169	2655174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469926
51619	NC_021883	ATTA	2	8	2655189	2655196	50 %	50 %	0 %	0 %	526469926
51620	NC_021883	CAAGA	2	10	2655215	2655224	60 %	0 %	20 %	20 %	526469926
51621	NC_021883	AGA	2	6	2655240	2655245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526469926
51622	NC_021883	AAT	2	6	2655274	2655279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526469926
51623	NC_021883	AAAAT	2	10	2655311	2655320	80 %	20 %	0 %	0 %	526469926
51624	NC_021883	AATT	2	8	2655380	2655387	50 %	50 %	0 %	0 %	526469926
51625	NC_021883	A	6	6	2655464	2655469	100 %	0 %	0 %	0 %	526469926
51626	NC_021883	A	6	6	2655475	2655480	100 %	0 %	0 %	0 %	526469926
51627	NC_021883	TGA	2	6	2655486	2655491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469926
51628	NC_021883	AAC	2	6	2655500	2655505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526469926
51629	NC_021883	AGG	2	6	2655510	2655515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526469926
51630	NC_021883	CTG	2	6	2655539	2655544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526469926
51631	NC_021883	CAA	2	6	2655583	2655588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526469926
51632	NC_021883	GCA	3	9	2655592	2655600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526469926
51633	NC_021883	CAA	2	6	2655640	2655645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526469926
51634	NC_021883	TTTA	2	8	2655647	2655654	25 %	75 %	0 %	0 %	526469926
51635	NC_021883	T	7	7	2655726	2655732	0 %	100 %	0 %	0 %	526469926
51636	NC_021883	AG	3	6	2655781	2655786	50 %	0 %	50 %	0 %	526469926
51637	NC_021883	ATA	2	6	2655811	2655816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526469927
51638	NC_021883	TG	3	6	2655834	2655839	0 %	50 %	50 %	0 %	526469927
51639	NC_021883	AATT	2	8	2655877	2655884	50 %	50 %	0 %	0 %	526469927
51640	NC_021883	CTT	2	6	2655911	2655916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526469927
51641	NC_021883	ATT	2	6	2655935	2655940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469927
51642	NC_021883	AT	3	6	2655971	2655976	50 %	50 %	0 %	0 %	526469927
51643	NC_021883	ATG	2	6	2656041	2656046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469927
51644	NC_021883	TTA	2	6	2656149	2656154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469927
51645	NC_021883	TTGG	2	8	2656210	2656217	0 %	50 %	50 %	0 %	526469927
51646	NC_021883	T	6	6	2656272	2656277	0 %	100 %	0 %	0 %	526469927
51647	NC_021883	TTAGGT	2	12	2656281	2656292	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	526469927
51648	NC_021883	CTT	2	6	2656355	2656360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526469927
51649	NC_021883	TTC	2	6	2656383	2656388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526469927
51650	NC_021883	ATT	2	6	2656530	2656535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469927
51651	NC_021883	TG	3	6	2656557	2656562	0 %	50 %	50 %	0 %	526469927
51652	NC_021883	GAT	2	6	2656591	2656596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469927
51653	NC_021883	GTAA	2	8	2656610	2656617	50 %	25 %	25 %	0 %	526469928
51654	NC_021883	TAA	2	6	2656630	2656635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526469928
51655	NC_021883	A	6	6	2656676	2656681	100 %	0 %	0 %	0 %	526469928
51656	NC_021883	CAA	2	6	2656761	2656766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526469928
51657	NC_021883	GTG	2	6	2656815	2656820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526469928
51658	NC_021883	TTCGT	2	10	2656854	2656863	0 %	60 %	20 %	20 %	526469928
51659	NC_021883	ATG	2	6	2656875	2656880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469928
51660	NC_021883	GAA	2	6	2656910	2656915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526469928
51661	NC_021883	TTC	2	6	2656960	2656965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526469928
51662	NC_021883	TGA	2	6	2657029	2657034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526469928
51663	NC_021883	AGA	2	6	2657173	2657178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526469928
51664	NC_021883	A	6	6	2657274	2657279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51665	NC_021883	GCT	2	6	2657573	2657578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526469929
51666	NC_021883	AGC	3	9	2657608	2657616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526469929
51667	NC_021883	ATT	2	6	2657674	2657679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526469929
51668	NC_021883	GCC	2	6	2657833	2657838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526469929
51669	NC_021883	TAAT	2	8	2657877	2657884	50 %	50 %	0 %	0 %	526469929
51670	NC_021883	GTAA	2	8	2657961	2657968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51671	NC_021883	TTCAA	2	10	2658007	2658016	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51672	NC_021883	CTT	2	6	2658048	2658053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51673	NC_021883	GTT	2	6	2658074	2658079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51674	NC_021883	TGA	2	6	2658082	2658087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51675	NC_021883	A	6	6	2658111	2658116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51676	NC_021883	TCA	2	6	2658124	2658129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51677	NC_021883	AG	3	6	2658142	2658147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51678	NC_021883	GTG	2	6	2658153	2658158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51679	NC_021883	A	6	6	2658183	2658188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51680	NC_021883	CTG	2	6	2658309	2658314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51681	NC_021883	AGCGT	2	10	2658441	2658450	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51682	NC_021883	T	6	6	2658479	2658484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...9293949596979899100101102103104Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.